日本産チビキカワムシ科は次の5亜科12属30種1亜種に分類されています。

82.1 Subfamily Othniinae LeConte, 1861 / クチキムシダマシ亜科 1属3種

82.2 Subfamily Prostominiinae Grouvelle, 1914 / ヒラタクチキダマシ亜科 3属4種

82.3 Subfamily Aegialitinae Horn, 1878 / イワハマムシ亜科 1属1種

82.4 Subfamily Inopeplinae Grouvelle, 1908 / ハネカクシダマシ亜科 2属3種1亜種

82.5 Subfamily Salpinginae Leach, 1815 / チビキカワムシ亜科 5属19種