日本産コメツキダマシ科は次の3亜科33属79種に分類されています。
 Subfamily Melasinae Fleming, 1821 ミゾナシコメツキダマシ亜科 18属48種
Subfamily Eucneminae Eschscholtz, 1829 コメツキダマシ亜科 3属5種
 Subfamily Macraulacinae Fleutiaux, 1923 チャイロコメツキダマシ亜科 12属26種